第二章 征途之始
阴差阳错，小杰来到了一个奇妙的世界，他一醒来就遇到一个自称是他母亲的女人，并且得知……第二天他就可以领到第一只神奇宝贝了！旅行，即将展开……
“小杰，起床了，今天是你领神奇宝贝的日子啊！”小杰睁开眼，发现一个女人在叫他。“妈妈……”小杰不由自主地叫了这两个字，据她所说她是小杰的母亲。
“好了好了，你看都几点了，你想不想领到神奇宝贝啊？”高美丽(也就是小杰的母亲）半开心半生气地说。“糟了！”小杰一看表，十点了，果然熬夜是不好的习惯啊！别和小智一样弄个叛逆神奇宝贝，那可就伤不起了。小杰心急火燎换好衣服就出去了。到了研究所，小杰发现柳木博士已经双手叉腰有点不耐烦地在等他了。“对不起，我又迟到了！”小杰抱歉地说。得，看起来又要重蹈小智的覆辙了……
博士生气地说:“怎么这么重要的日子你也会迟到！算了，你自己看看现在是什么情况吧。”随着博士手指的方向，小杰呆得下巴都掉下来了，装载神奇宝贝球的容器空空如也，全部被领走了！博士解释说:“本来今天只有三个新人的所以我只准备了三只神奇宝贝，没想到突然加入一个由于疏忽被遗漏掉的孩子，所以就少了一只。”真是的，这是什么神棍剧情，怎么运气总是这么好！而且，小杰这才发现不对劲的地方，为什么处在日本的神奇宝贝世界大家都说中文？好吧，不得不为任天堂细致入微的汉化工作点赞！
小杰当然非常沮丧，失望之余无意中瞥见有一个神奇宝贝球放在高处，便满怀希望地问道：“博士，那只神奇宝贝可以给我吗？"博士惊愕地说：“你确定要那只神奇宝贝？”小杰疑惑地问：“对呀，不可以吗？”博士摇头说：“算了吧，也曾经有许多新人对这只神奇宝贝感兴趣，但是它太凶狠孤傲了，所以他们到最后都只能放弃……罢了，反正也没有多余的神奇宝贝了，能遇上也算是你们的缘分，你姑且试试看能不能驯服它吧。”
听博士这样一说小杰更是来了兴趣，有个性的神奇宝贝可塑性要更强，而且敢狂傲说明它有狂傲的资本啊！神奇宝贝球一抛，出场的是一只黑目鳄，黑目鳄的属性是地加恶，而特性是自信过剩，每打倒一个对手攻击力上升一级。黑目鳄还带着一副墨镜，小杰也知道如果黑目鳄失去墨镜会变得非常软弱，算是一点弱点的存在吧。小杰发现自己触摸到从未接触的神奇宝贝并没有掉鸡皮疙瘩之类的害怕表现，一方面是因为他在之前的比赛中已经有过初次体验，另一方面或许是他对神奇宝贝的喜爱已经超过了恐惧了吧。
小杰满心欢喜地对黑目鳄说：“黑目鳄，做我的伙伴吧。”说着想要去抱它，却被它一个冲击撞飞。黑目鳄头偏向后院，博士解释：“每个想要带走它的训练家必须去后院与它对战，只有胜利了才能使它心甘情愿地跟随。”小杰为难地说：“我只是一个普通人而已，又不会什么技能，怎么可能打败神奇宝贝呢？”
黑目鳄一扭头，转过去了。博士解释说：“这个动作表示胆小可以离开，黑目鳄不会承认你为它的训练师的。以往所有对他感兴趣的新人都是在这里退缩的。”小杰被这么一激斗志反倒被激起来了，也不顾实力悬殊就贸然同意了：“好，我接受它的挑战！”
后院，小杰被打的灰头土脸狼狈不堪，黑目鳄又是撞又是咬的小杰完全无法招架……黑目鳄想用咬咬给小杰来个最后一击，没想到用力过猛一甩头墨镜飞池塘里了。黑目鳄开始手足慌乱，小杰知道，这一只特殊的黑目鳄没有墨镜是绝对不行的，黑目鳄又是地系，不敢下水去打捞墨镜，这怎么行，小杰最见不得神奇宝贝受苦了！几乎是什么都没有多想，为了救黑目鳄小杰奋不顾身一个猛子扎入池塘，潜到池塘底捡起墨镜然后浮到水面扔给黑目鳄：“黑目鳄，接着！”正好扔中目标位置，然后小杰还来不及高兴又想到一件很重要的事——他自己也不会游泳啊！小杰挣扎了几下，沉到池塘底了，从池底冒出几个泡泡就没反应了……此时黑目鳄乱叫了几声，意义不明，然后就跑掉了。
小杰意识模糊，只觉得有人在扯他的肩膀，难道是无常来索命了？小杰胡乱挣扎说：“不，别带走我！”一下惊醒过来，发现自己躺在一张病床上，坐在边上的是博士和黑目鳄。博士说：“真是的，不会游泳别逞强呀，这么浅的池子你也能淹着。还好黑目鳄及时提醒我，否则你就可能成为我后院池塘的冤鬼了！”
小杰松了口气笑着说：“黑目鳄，原来你没事啊，太好了。谢谢你救了我。怎么样，愿意成为我的伙伴吗陪我一起旅行吗？”黑目鳄立刻跳入小杰怀中，小杰大喊：“我收服黒目鳄啦！”博士也鼓掌说:“嗯，看来你在关键时刻不顾自己的精神已经感动了黑目鳄，它已经被你的人格魅力征服了呢，可喜可贺，可喜可贺！”